Anfang 1853 lieferte der Orgelbauer Schmid aus Oldenburg eine kleine Orgel für die Schulkapelle in Fladderlohausen. Nach nur dreißig Jahren war sie aber so schadhaft, dass sie durch ein Hamonium ersetzt werden musste. Auch in der neuen Kirche wurde ab 1936 zunächst nur ein Harmonium verwendet. 1952 schaffte die Gemeinde schließlich eine gebrauchte Pfeifenorgel mit sechs Registern auf einem Manual und Pedal an und stellte sie auf der Empore auf.

Da dieses Instrument aber auch nicht für längere Zeit ordnungsgemäß funktionierte, baute die Orgelbauwerkstatt Alfred Führer (Wilhelmshaven) 1962 eine neue Orgel mit sechs Registern für die Christuskirche. Die Orgelweihe fand am 9. Dezember 1962 statt. Im Jahr 1980 führte der Oldenburger Orgelbauer Hermann Stahl eine Generalreinigung und Instandsetzung durch. Eine weitere Reinigung und Überholung erfolgte 2001 durch Orgelbau Führer, bei der u. a. die zusammengesackten großen Prospektpfeifen erneuert wurden.

Das Hauptgehäuse ist in die Emporenbrüstung eingebaut, dahinter steht frei der Spieltisch. Einige Pfeifen des Pedalregisters Subbass stehen in den beiden seitlichen Pfeifentürmen. Neben der Manualklaviatur sind im Spieltisch links und rechts jeweils drei Registerzüge eingebaut.